Биоинформатик

Автор: Артём Орлов
Обновлено
Биоинформатик

Биоинформатик анализирует статистические, научные и экспериментальные медико-биологические данные. Он разрабатывает и применяет алгоритмические, вычислительные и автоматизированные средства и методы обработки больших объемов информации в области медицины и биологии.  Кстати, в 2021 году центр профориентации ПрофГид разработал точный тест на профориентацию. Он сам расскажет вам, какие профессии вам подходят, даст заключение о вашем типе личности и интеллекте.

Вы даже не подозреваете, какая мощь скрывается внутри вас. Всё, что вам нужно сделать — это узнать, в чём ваша сила и как её применить. Тест «Талантум» основан на практиках, применяемых успешными людьми.

Содержание:
Читайте также :

Краткое описание

Современные методы диагностики и исследований приводят к росту количества научных данных, которые вручную обрабатывать очень сложно. На помощь приходит биоинформатика – по сути, математическая биология. Она сформировалась как междисциплинарная наука во второй половине XX века. Биоинформатики пользуются элементами прикладной математики, статистики, информатики. В работе им нужны:

  • языки программирования, преимущественно Java, С, С++, С#, R;
  • язык разметки HTML;
  • программы: ACT, BLAST, Clustal, MEGA, Arlequin и другое специализированное ПО;
  • SQL, CUDA.

Основные области исследования:

  • анализ генетических последовательностей, эволюционная вычислительная биология;
  • проведение оценки биологического разнообразия, аннотация геномов.

Интересы биоинформатиков главным образом направлены:

  • на изучение геномов;
  • анализ и прогнозирование структуры белков, взаимодействий молекул белка друг с другом и другими молекулами;
  • реконструкцию эволюции.

Биоинформатики работают с так называемыми расшифрованными, прочитанными (на научном языке – секвенированными) геномами – содержащейся в клетках биологической информацией.

Отличие от биологов:

  • Биоинформатики не работают «в поле» или с препаратами и микроскопами в лабораториях и не анализируют геном на графических схемах, а изучают его как программный код.
  • Биоинформатик – это «белый воротничок» науки, «офисный служащий». Он не проводит эксперименты, а обрабатывает результаты экспериментов за компьютером – анализирует базы биологических и медицинских данных, которые уже собрали практики-исследователи.

Отличие от биоинженеров:

  • Биоинформатики – это теоретики, биоинженеры – это практики-экспериментаторы. Биоинженеры изменяют свойства живых организмов, разрабатывают приборы, которые помогают решать медицинские или экологические проблемы. Среди их достижений: технологии искусственного выращивания органов для трансплантации; аппараты диализа, искусственного кровообращения; кардиостимуляторы; штаммы бактерий, очищающие воду от загрязнений нефтью, и многое другое. 

Профессия молодая, в дальнейшем она будет развиваться еще более стремительно, ведь применение вычислительных методов гарантирует высокую точность, скорость и исключает человеческий фактор. Технологии биоинформатики необходимы в биохимии, биофизике, экологии, фармакологии, сельском хозяйстве, генетике и других сферах.

Читайте также :

Особенности профессии

Биоинформатика находится на стыке медицины, биологии, прикладной математики, информатики.

В обязанности биоинформатиков входит решение глобальных задач:

  • поиск методов лечения онкологических, хронических, аутоиммунных заболеваний;
  • продление срока жизни человека, поиск генома долголетия;
  • создание экологически безопасных технологий;
  • разработка, планирование, внедрение математических методов, алгоритмов, программ, используемых для анализа медицинской и биологической информации;
  • применение полученных результатов на практике.

Области исследования обширные, но у биоинформатики огромный потенциал. 

Международный рынок труда уже испытывает дефицит биоинформатиков, в них заинтересованы фармакологические и IT-компании, медицинские центры и лаборатории, агропромышленные концерны.

Биоинформатик должен обладать безупречными знаниями в сфере медицины и биологии, разбираться в сложных профессиональных терминах, огромным плюсом станет знание английского языка. Большую часть рабочего времени эксперты в этой области проводят за компьютером, работа малоподвижная, но имеет огромное социальное значение.

Плюсы и минусы профессии

Плюсы

  1. Очень перспективная сфера деятельности. Рост массивов данных приведет к еще большей востребованности биоинформатиков.
  2. Из года в год в этом сегменте наблюдается стабильный рост заработных плат.
  3. У биоинформатиков много специализаций – они могут работать и в отечественных исследовательских центрах, и в крупных международных IT-компаниях, и в агропромышленном комплексе.
  4. Для работы используются математические методы, компьютерные программы – биоинформатики не взаимодействуют с пациентами или биологическими материалами.
  5. Знание языков программирования и основ прикладной математики позволяют биоинформатику выбрать другой сегмент деятельности. Например, классическое программирование, разработка и тестирование программ.
  6. Постоянное саморазвитие и совершенствование профессиональных навыков.
  7. Моральное удовлетворение от осознания социальной значимости результатов работы. 
  8. Области исследования биоинформатики получают активную поддержку государства.

Минусы

  1. Работая сидячая, сопряжена с усиленной мозговой активностью.
  2. Профессия больше подходит для людей с техническим складом ума.
  3. У молодых биоинформатиков без опыта работы могут возникнуть проблемы при трудоустройстве.
  4. Некоторые врачи с недоверием относятся к этому междисциплинарному направлению.

Важные личные качества

Биоинформатикам нужны:

  • склонность к точным наукам;
  • усидчивость;
  • способность работать с большими объемами информации;
  • методичность;
  • способность генерировать идеи. 

Биоинформатики – это собранные люди с хорошо развитым системным и критическим мышлением. Также в их характере преобладают сдержанность, немногословность, умение хранить медицинскую тайну.

Обучение на биоинформатика

Вузы

Биоинформатика только набирает популярность, но профильные факультеты уже открываются в российских вузах. Основное направление подготовки – «Биоинженерия и биоинформатика» (код: 06.05.01).

Для поступления на биоинформатику надо сдать:

  • ЕГЭ по профильной математике;
  • русский язык – по умолчанию, как и на любое вузовское направление;
  • остальные экзамены зависят от требований вуза, но чаще всего это биология, химия, физика или информатика (1-2 из перечисленных).

Подготовкой биоинформатиков занимаются немногие российские вузы. Проходной балл по предмету составляет 64–92, бюджетных мест – не более 30. Форма обучения – очная, срок – 5 лет (специалитет).

В некоторых вузах биоинформатику можно изучать на профилях программ бакалавриата:

  • 01.03.02 Прикладная математика и информатика:
    • профиль «Биониформатика» (СПбГУПТД, СПбПУ, ПущГЕНИ);
  • 03.03.01 Прикладные математика и физика:
    • профиль «Медицинская физика и биоинформатика» (МФТИ);
    • профиль «Биоинформатика» (СПбАУ РАН им. Алфёрова).

Лучшие вузы для биоинформатика

  1. МГУ им. М. В. Ломоносова.
  2. Первый МГМУ им. Сеченова.
  3. МФТИ.
  4. БФУ им. И. Канта.
  5. БашГУ.
  6. ИГУ.
  7. ВолГУ.
  8. МГУ им. Н. П. Огарева.
  9. ВГУИТ.
  10. ТюмГУ.

Место работы

В биоинформатиках заинтересованы компании, работающие в следующих сферах:

  • профилактическая, клиническая, персонализированная медицина;
  • фармакология и фармация;
  • научно-исследовательская деятельность;
  • животноводство;
  • IT;
  • геномная инженерия;
  • биотехнология, биохимия, биофизика.

Заработная плата

Работа биоинформатиков оплачивается очень хорошо, в зарубежных компаниях ставки ненамного выше, чем в отечественных. Наиболее ценятся специалисты, безупречно владеющие разговорным и техническим английским языком, умеющие применять его на практике. Размер зарплаты зависит от профессиональных навыков и может корректироваться в процессе работы. Многие компании предоставляют биоинформатикам служебное жилье, компенсируют затраты на проезд, питание.

Зарплата биоинформатика на май 2022

Информации о зарплатах предоставлена порталом hh.ru.

Россия 60000—65000₽
Москва 60000—170000₽

Профессиональные знания

  1. Языки программирования.
  2. Фундаментальные знания в области биологических систем.
  3. Базовые программы, используемые в биоинформатике.
  4. Электронные таблицы, базы данных, язык разметки.
  5. Секвенирование, анализ данных NGS, CUDA.
  6. Иностранный язык, прикладная математика.
Читайте также :

Примеры компаний с вакансиями биоинформатика

  • Python Senior Backend Developer
  • Test Automation Engineer
  • Auto QA engineer
  • Middle QA Engineer
  • Младший научный сотрудник (Вычислительная биология)
  • Администратор салона аппаратного массажа (БЭМ)
star_rate star_rate star_rate star_rate star_rate
  • Олег Ларин
    Здравствуйте, не подскажите, откуда информация об использование вышенаписанных языков в биоинформатике?
  • Виктория Шейх Халиль
    star_rate star_rate star_rate star_rate star_rate
    Олег Ларин, из разных источников: 1) http://www.fbb.msu.ru/news/view.php?ID=615; 2) https://mse.itmo.ru/education; 3) Python for Bioinformatics Книга, Себастиан Басси; 4) https://fbmf.mipt.ru/master/iogen/ И другие источники